在《金剛戰神》播映完畢後過了半世紀，這部備受粉絲期待的名作終於重製成了全新動畫作品。
本作由福田己津央先生擔任總導演，並集結了眾多知名創作者參與製作。在創作過程中，每位工作人員都有各自心目中的《金剛戰神》，在融合每位參與者對《金剛戰神》的深刻情懷之餘，也尊重原作精神，也尊重原作精神，將《金剛戰神》這部作品的由來與與核心主題，進行了符合當今時代的重新詮釋。重構後的故事與登場角色不僅保留了原版的要素，也能讓人明確感受到注入作品的新活力，讓新時代的《金剛戰神》在往年粉絲與首次接觸的觀眾心中都留下了深刻印象。

大介……被如此稱呼的他並沒有記憶。
他出現在沙漠中確認到的UAP（未確認空中現象）墜落地點，並由世界級大富豪兼正義的夥伴兜甲兒所收留，過著平穩的日子。
就在某一天，來自宇宙的外星人軍隊「費加聯軍」來襲，其壓倒性的技術實力讓甲兒所駕駛的鋼鐵城堡「無敵鐵金剛Z」也陷入了苦戰。就在人們開始陷入絕望的那刻，沙塵中出現了神祕的巨大機器人。
機器人名叫克雷飛天神。駕駛著別名「弗瑞德星的守護神」的巨人現蹤的，是恢復了記憶的大介──真實身分為弗瑞德星的王子狄克‧弗瑞德。
狄克投身戰火，並開始面對自身所背負的哀傷過往……